中西医结合手外科：国家级中西医结合重点专科(病)建设项目、浙江省中医重点专科
关节病专科：浙江省中医关节病医疗中心
儿童哮喘专科：浙江省中医重点专、杭州市中西医结合防治儿童哮喘病诊疗基地、全国中医儿科呼吸系统疾病临床继续教育基地、浙江省中医药优势学科培训基地、浙江省农村中医药人才培养基地
口腔专科：萧山口腔医院、浙江中医药大学口腔系临床实习基地
创伤急救中心、脑血管病（中风）防治中心、脊柱创伤、腹腔镜微创手术、肛肠、推拿、针灸、竹林寺女科、韩氏儿科、消化内科、中西医结合糖尿病等院内重点专科、专病在群众中享有较高声誉。